Programme

Le Master se déroule sur deux années (M1 et M2) et repose sur une approche par projets permettant aux étudiants d'acquérir des compétences pratiques en bioinformatique.

M1

Master 1

Semestre 1

Mise à niveau en Unix et R

Sciences Biologiques

  • Biochimie / Biophysique
  • Biologie innovante

Bio-informatique fondamentale

  • Bio-informatique des omiques
  • Bio-informatique structurale

Informatique et Mathématiques

  • Optimisation et Méthodes d'Apprentissage Automatique
  • Biostatistiques et programmation R
  • Python

Professionnalisation

  • Anglais
  • Initiation à la recherche
  • Base de données
  • Algorithmique
  • Programmation avancée
  • Automates Avancés et Applications
  • Introduction à l'IA et la théorie de jeux
  • Langages à objet avancés
  • Applications en bioinformatique et en médecine

Semestre 2

Fondamentaux Avancés

  • Intelligence artificielle
  • Biologie des omiques

Spécialisation

  • Bioinformatique structurale 2
  • Initiation au drug design
  • Biologie des omiques
  • Génétique des populations
  • Génomique computationnelle
  • Programmation Web
  • Protein-Protein Docking
  • Traitement d'images
  • Traitement du signal
  • Algorithmique 2
  • Python 2
  • Ouverture vers la recherche prospective

Professionnalisation 2

  • Stage long de recherche
  • Synthèse bibliographique
M2

Master 2

Semestre 3

Gestion de projet informatique et programmation avancée

Sciences des données

  • Intelligence artificielle : Méthodologies récentes et dernières avancées
  • Apprentissage automatique et profond

Bioinformatique des omiques avancée

  • Omique computationnelle avancée
  • Bioinformatique de la métagénomique

Bioinformatique structurale avancée

  • Bioinformatique structurale avancée et modélisation moléculaire
  • Applications en bioinformatique structurale

Spécialisation Bioinformatique

  • Bioinformatique intégrative et systémique
  • Bioinformatique médicale

Application et spécialisation professionnelle

  • Projets de Recherche et Développement: Méthodologies et applications
  • Conception et Gestion de Projets Innovants en R&D: De l'Idée à la Réalisation

Semestre 4

Stage

5-6 mois

Formation en alternance

S1 : 3 à 3,5 jours cours + 1,5 à 2 jours stage ou projets tuteurés.
S2 : Janv. à mi-mars cours, mi-mars à juin stage (FI) ou fin août (FA/FP).
M2 : Alternance cours/stage : 1 à 2 mois cours alternés avec 1 à 2 mois stage. À partir de juillet stage. 25 à 30 h par semaine.

Stages et projets tutorés

Outre les stages qui se déroulent en laboratoire ou en entreprise, plusieurs projets tutorés de complexité croissante proposés par des professionnels contribuent à la formation par la pratique.

Les stages peuvent être réalisés au sein du même laboratoire ou dans des laboratoires différents, excepté pour les alternants qui les effectuent dans la même entreprise.

Contrôle des connaissances

Contrôle continu et examen. Le contrôle des connaissances s'effectue sous forme de réalisation de projets, de compte-rendu de travaux pratiques, de synthèse de travaux et d'évaluation des cours en pédagogie inversée.

Pour les alternants, les séjours en entreprise s'effectuent en Novembre, de mi-Janvier à mi-Mars et de Mai à fin Août.

Compétences visées

Disciplinaires

Méthodes de bioinformatique Biologie moderne Outils logiciels & bases de données Bioinformatique structurale Approches omiques Biologie systémique Conception de projets R&D Coordination avec les biologistes

Techniques

Python & R Apprentissage automatique & profond Analyse de données massives Algorithmique avancée Bases de données Programmation orientée objet Unix & outils système

Transversales

Anglais scientifique Communication écrite & orale Rigueur & méthode Synthèse bibliographique Gestion de projet Travail en équipe interdisciplinaire Sens de l'initiative Veille scientifique & technologique